L’any 392 l’emperador Teodosi va decretar la prohibició dels sacrificis pagans i molts ciutadans de l’Imperi es van veure obligats a profesar la nova religió. En aquest clima de forta repressió es va produir la segona destrucció de la biblioteca d’Alexandria i la del gran temple de Serapis (Serapeum) per una multitud de fanàtics cristians encapçalada pel patriarca de la ciutat, Teòfil. El seu nebot i succesor, Ciril, va desterrar d’Alexandria als jueus, va fer perseguir als pagans i a les altres confessions cristianes (novacians i nestorians)i va aprovar l’assassinat d’Hipàtia l’any 415.

Una història repetida, els antics perseguits esdevenen perseguidors quan ocupen el poder de l’Estat.